合作開發是指兩個以上的自然人、法人或者其他組織共同進行的開發。共同開發完成軟體作品的著作權的歸屬如何確定呢?
實踐中，軟體的開發涉及很多方面的工作，例如軟體的需求分析、功能設計、演算法設計、程式設計以及測試，這些工作可以是一個人做，也可以是多人合作，相應的合作開發的形式也是多樣的：有的合作者提供開發思路，有的合作者提供程式設計創作，有的合作者提供需求分析，有的合作者提供資金、裝置。
在眾多的合作者中，如何確定軟體著作權的歸屬呢?沒有參加創作、但提供了裝置和資金的合作者能否享有著作權呢?《著作權法》第13條規定，兩人以上合作創作的作品，著作權由合作作者共同享有。沒有參加創作的人，不能成為合作作者。但是對於軟體作品而言，其開發組織工作較一般的文字作品的創作更為複雜，不僅涉及眾多的參與人員，而且對裝置、資金的需求較大。如果提供了資金和裝置的合作者不能享有合作軟體的著作權，顯然不利於鼓勵軟體作品的開發。因此，《計算機軟體保護條例》並沒有按照《著作權法》的規定將合作開發的組織者和資金提供方等排除在開發者之外，合作開發的軟體的著作權歸屬由合作開發者簽訂書面合同約定。
既然合作開發者可以在書面合同中約定軟體的著作權，那麼合作開發者在合同中既可以約定一部分合作者享有著作權，一部分合作者不享有著作權;也可以約定不同的合作者享有不同的軟體的著作權。例如：可以約定一部分合作者對合作開發的軟體僅享有署名權而不享有複製發行權和獲得報酬權。
在軟體合作開發合同中，著作權的歸屬是一項重要的內容。涉及著作權的歸屬問題應該涵蓋以下幾項內容：
(1)著作權歸屬於誰?合同中應該明確合作開發的軟體的著作權是合作開發者共有還是由部分合作開發者享有。
(2)開發者擁有著作權的具體內容是什麼?合同中應該明確擁有著作權的開發者都享有著作權的哪些權利，例如署名權、使用權、許可他人使用權和銷售權。
(3)其他開發者對於合作開發的軟體是否還享有其他權利?雖然合同中可以約定合作開發軟體的著作權歸屬於某一開發者，但是對於其他開發者是否還有一定的權利，例如為了宣傳的目的進行軟體展示的權利或者在自己內部使用的權利等等。
(4)對於合作開發軟體的升級開發的權利是如何約定的?軟體開發完成以後即獲得了著作權。但隨著技術的進步和實際應用需求的變化，任何一個軟體開發完成後都不會是一勞永逸的，軟體是需要進行升級開發的。升級開發一方面可以修改以前版本的軟體存在的缺陷，另一方面可以根據使用者需求的反饋增加軟體的功能或者根據技術的進步增加軟體對系統軟硬體環境的適應性。對於軟體升級版本的開發是軟體開發者的一種權利。因此，合作開發合同中應該明確軟體升級版本開發的權利歸屬。
需要明確的是，《計算機軟體保護條例》明確規定合作開發合同應該通過書面方式簽訂。如果沒有簽訂書面合同，則很難界定清楚著作權的歸屬，一旦出現糾紛，就更無法證實當初的約定。此種情況下，只能按照無書面合同處理。
沒有書面合同的，對於可以分割的軟體，開發者對各自開發的部分可以單獨享有著作權;但是，行使著作權時，不得擴充套件到合作開發的軟體整體的著作權。這一原則充分尊重了軟體開發者的勞動，既保護了軟體開發者的權利，符合著作權屬於作者的基本版權原則，又限制了分割部分軟體的著作權行使範圍僅限於該分割的部分，不能擴充套件到合作開發的軟體整體。
對於不能分割使用的軟體，合作開發的軟體著作權是依據民法“共有”的原則處理的。共有是兩個或者兩個以上的人(自然人或者法人)對同一項財產享有所有權。共有的法律特徵包括三方面：
(1)共有的主體不是單一的，而是兩個或者兩個以上的自然人或者法人。兩個以上的自然人、法人或者其他組織合作開發的軟體著作權的主體符合共有這一主體特徵。
(2)共有的客體是特定的獨立的物，共有物在共有關係存續期間，不能分割為各個部分由各個共有人分別享有所有權，而是由各個共有人共同享有其所有權，各個共有人的權利及於共有物的全部。
(3)共有人對共有物平等地享有權利。共有人對於自己的權利的行使並不是完全獨立的，在許多情況下要體現全體共有人的意志，要受其他共有人的利益的制約。
按照共有的上述法律特徵，《計算機軟體保護條例》明確規定，合作開發的軟體不能分割使用的，其著作權由各合作開發者共同享有，通過協商一致行使。
對於不能協商一致，又無正當理由的，任何一方不得阻止他方行使除轉讓權以外的其他權利，但是所得收益應當合理分配給所有合作開發者。這裡，法律賦予了軟體合作開發者對合作軟體的合理使用和獲得報酬權，但前提是取得的收益應合理分配給所有合作開發者，並且任何合作方未經其他各方的同意，不得擅自轉讓合作軟體的著作權。這樣，既保護了軟體合作開發者的個體利益，也維護了合作開發者的群體利益。
軟體合作開發合同範本
甲方：_______，身份證號_______
乙方：_______，身份證號_______
丙方：_______，身份證號_______
丁方：_______，工商執照號_____
鑑於，協議各方均為計算機軟體專業開發人員，能夠進行創造性的軟體開發活動。並且，協議各方有意願共同從事_______軟體的開發工作。為了規範各方的權利義務，在《中華人民共和國合同法》及其他相關法規政策的原則指導下，訂立本協議書，各方共同遵守：
第一條 、合作宗旨
為完成______軟體的開發工作，並共同享有開發成果而合作。
第二條 合作專案和範圍
協議各方共同開發______軟體，合作範圍包括軟體的程式碼編寫、除錯、測試等開發工作。
第三條 合作期限
合作期限為一年。
第四條 合作方式
1.協議各方按照軟體程式設計工作的正常分工進行編寫，任何一方不得隨意更改軟體的重大功能和事項，以免對其餘各方造成履約困難。
2.合作各方應堅持勤勉努力誠實信用的原則，進行各方分別負責的軟體的程式設計工作，並考慮到各方軟體的相容和接合。如部分合作人發生特殊技術困難，其餘合作方有義務為其提供合理適當的技術幫助。
第五條 智慧財產權
1.各方編寫的軟體原始碼、技術文件及彙編而成的程式本身，其著作權均由合作方共同享有。
2.各作各方在編寫軟體的過程中，不得有侵犯他人智慧財產權的行為，否則，應對外承擔全部侵權責任。
第六條 協議變更
1.經合作各方協商同意，本協議可以作相應變更
2.任何合作方未經與其他各方協商，擅自變更本協議條款或者將本協議權利義務轉讓他人，均為無效。
第七條 禁止行為
1.未經全體合作人同意，禁止任何合作人私自以團體名義進行業務活動如其業務獲得利益歸合作各方共有，造成損失按實際損失賠償。
2.禁止合作人經營與團隊相競爭的業務。
3.禁止合作方洩露本協議所涉及的相關商業祕密。
4.如合作人違反上述各條，應按實際損失賠償。
第八條 合作的終止
合作開發活動因以下事由之一得終止：
①全體合作人同意終止合作關係②合作專案因技術原因，根本不能完成③合作專案違反法律被撤銷。
甲方：_______，身份證號_______
乙方：_______，身份證號_______
丙方：_______，身份證號_______
丁方：_______，工商執照號_____
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