這真是一片奇妙又少見的海底森林，生長的都是高大的木本植物，小樹上叢生的枝權都筆直伸向洋麵。沒有技條，沒有葉脈，像鐵桿一樣。在這像溫帶樹林一般高大的各種不同的灌木中間，遍地生長著帶有生動花朵的各色珊瑚。美麗極了!
爾後，潛艇經歷了擱淺、土人圍攻等危險，安然駛向印度洋。這時發生了一件離奇的事。尼摩船長從海面上望見了什麼，突然充滿了憤怒和仇恨。他粗暴地把阿龍納斯及其同伴們禁閉在小房間裡，並強迫他們人睡。翌日，阿龍納斯醒來，尼摩船長請他治療一個身受重傷的船員。船員不治身死。尼摩船長哀痛地帶著送葬隊伍，把死者埋在海底光彩奪目、瑰麗無比的珊瑚樹林裡。他說：在這裡，珊瑚蟲會把死者永遠封閉起來，不受鯊魚和人的欺負!
印度半島南端的錫蘭島在面前了。阿龍納斯接受尼摩船長的建議，步行到海底採珠場。忽然，有條巨鯊向採珠人撲來。尼摩船長手拿短刀，挺身跟鯊魚搏鬥。在尼摩船長被鯊魚的巨大軀體所壓倒，危在旦夕對，尼德·蘭迅速投出利叉，擊中鯊魚的心臟。船長救起那個窮苦的採珠人，又從自己口袋裡取出一包珍珠送給他。由此，阿龍納斯感到在尼摩身上有兩點值得注意：一是他無比勇敢，二是他對人類的犧牲精神。看來，這個古怪的人還沒有完全斬斷他愛人類的感情。
從紅海到地中海，若走好望角，需繞行非洲一週。但尼摩船長沿著他所發現的一條阿拉伯海底通道潛行，不到二十分鐘，就通過蘇伊土地峽，到達地中海。書中寫道：
諾第留斯在沿著又黑又深海底地道直衝過去。隨著地道的斜坡，潛艇像箭一般隨急流而下。地道兩邊狹窄的高牆上，只見飛奔的速度在電光下所畫出的輝煌紋路，筆直成條。令我們心跳不止。
潛艇向康地島駛去。這時，又發生了一件蹊蹺事：隨著凌晨潛艇窗前一個潛水人的出現，尼摩船長從櫥內取出數百萬黃金，寫上地址，派人用小艇送走。這麼多金子送到哪裡呢?阿龍納斯覺得，神祕的尼摩與陸地仍有某種聯絡。
潛艇穿過桑多林島火山區海域的沸騰的水流，從直布羅陀海峽出來，駛到大西洋，停在維多灣海底。這裡是172017年時的海軍戰場，當時給西班牙政府運送金銀的船隻在此沉沒，海底鋪滿了金銀珠寶。尼摩派出船員，把千百萬金銀裝進潛艇。阿龍納斯對這許多財富不能分給窮人表示惋惜。船長聽了激動地回答：“我打撈這些財物是為了我自己嗎?你以為我不知道世上有無數受苦的人們，有被壓迫的種族，有要報仇的犧牲者嗎?”阿龍納斯於是明白了尼摩船長那次途經康地島時送出去的數百萬金子是給誰的。
在大西洋海底，阿龍納斯隨尼摩船長去做了一次新奇旅行;他們腳踩在沉沒了的大陸——一大西洋洲的一座山峰上，觀賞一座火山的海底噴火口噴出硫磺火石的奇景。眺望山腳下一座破壞了的城市—一整個沉沒水底的龐貝城。
在挪威沿岸一帶的危險海域中，阿龍納斯和尼德·蘭、康塞爾，乘坐小艇脫離了諾第留斯號，結束了這次穿過太平洋、印度洋、紅海、地中海、南北兩極海洋的海底兩萬裡環球旅行。阿龍納斯希望：“如果尼摩船長老是居住在他所選擇的海洋中，但願所有仇恨都在這顆倔強的心中平息!……但願他這個高明的學者繼續做和平的探工作!”
這部小說中情節設定古怪離奇，生動形象地描繪了充滿神祕色彩的海底世界。語言生動有趣，既是藝術的語言，又是科學的語言，對各種海底事物的說明人木三分，惟妙惟肖。
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